W przypadku przewlekłego zapalenia trzustki główną dolegliwością jest ból brzucha. Ma on charakter piekący, przeszywający, świdrujący lub ściskający; jest nawracający, uporczywy i ma zróżnicowane, czasem znaczne nasilenie. Występuje głównie po posiłku (po ok. 15-30 min.). Inne objawy choroby to postępująca utrata masy ciała, podwyższony poziom glukozy we krwi – nieprawidłowa tolerancja glukozy i stopniowo rozwijająca się cukrzyca, uporczywa biegunka zwykle o charakterze tłuszczowym, będąca skutkiem niepełnego trawienia pokarmów na skutek niedoboru enzymów trzustkowych.